天神爱上凡人，这原本就是不被允许的事情。但是，天宫中的三圣母（徐帆 配音）却执意爱上了人间的书生刘彦昌。不顾二郎神（姜文 配音）的反对，三圣母带着神器宝莲灯私下凡间与刘彦昌私定终身并生下一子取名叫沉香。平静、幸福的七年很快就过去了，有一天二郎神突然下凡，并用小沉香威胁三圣母交出宝莲灯并被其压在华山下...。一个美好的家庭也由此破碎。沉香从土地神口中知道了自己的身世，为了夺回宝莲灯，救出母亲，由此踏上了艰辛的寻母之路。多年的磨练，让沉香成长为一个英勇的少年，并在孙悟空（陈佩斯 配音）的点拨下，获得一把神斧，最终宝莲灯与沉香合二为一，战胜了二郎神，劈开华山，救出了母亲。
为了沉香在宝莲灯中开掘仙丹的威力，小玉将自己身体内的鲜血全部输给了宝莲灯，最后舍身变成了一粒莲子，落回灯芯的位置，使沉香在灯内将功力达到最高境界，人灯合一。 沉香跃上空中，高举起神斧，劈向乾坤钵
沉香经受住了考验，用自己的鲜血换来成千上万人的生。在牺牲之神面前，沉香又赢了。巨石缓缓移开，开天神斧就放在巨石下。丁香帮助沉香慢慢举起了神斧。但二郎神的声音又在她心中出现了，丁香埋怨二郎神控制自己
